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FFmpeg最新版(2014/11/15現在)、rev.67678(05e4b25)のWindows用バイナリを置いておきます。

ffmpeg_bin-67678.zip
ffmpeg_bin_pentium4-67678.zip (Pentium4最適化版)
ffmpeg_bin_core2-67678.zip (Core2最適化版)
ffmpeg_bin_athlon64-67678.zip (Athlon64最適化版)
ffmpeg_bin_phenom-67678.zip (Phenom最適化版)

ffplay_bin-67678.zip
ffprobe_bin-67678.zip

以下のライブラリをアップデートしました。

libvpx-v1.3.0-4832-gc3a9056
x264 rev.2491 git-24e4fed
x265 1.4+67-8191e0d02455

その他、gcc-4.9.2、mingw-w64-v3.3.0で、全部コンパイルし直しました。


バイナリはどれを使っても大丈夫だと思いますが、SSE2に対応していないCPU(Duron、Sempronの一部、Pentium3など)をお使いの方は、最適化無し版を使ってみてください。

最適化無し版でもエラーが出る場合は、サポート外とします。

zipファイルを解凍すると、ffmpeg.exeが出てきますので、携帯動画変換君のcoresフォルダに置くなり、単体で使うなりしてください。

携帯動画変換君のffmpeg.exeとは、オプションの互換性がありませんので、上書きする際はご注意ください。

FFmpegのコンパイルは、以下の記事を参考にしてください。
FFmpegのコンパイル (2014/02/17)

コンパイル環境：MinGW gcc-4.9.2
binutils-2.24
mingw-w64-v3.3.0

各ライブラリのバージョンは、以下の通りです。
nasm-2.11.06
yasm-1.3.0
zlib-1.2.8
bzip2-1.0.6
libbluray-0.6.2
libcaca-0.99.beta19
libcdio-0.93
libcdio-paranoia-10.2+0.93+1
game-music-emu-0.6.0
gsm-1.0.13
libilbc-1.1.1-20140918-git-abae780
libmodplug-0.8.8.5
lame-3.99.5
openjpeg-1.5.2
opus-1.1
opencore-amr-0.1.3
vid.stab-0.98-20141021-git-2c52016
vo-aacenc-0.1.3
vo-amrwbenc-0.1.3
polarssl-1.3.9
rtmpdump-2.4-20140706-git-a1900c3 PolarSSL版
libogg-1.3.2
aoTuV Beta6.03 (2014)
libtheora-1.1.1
speex-1.2rc1
twolame-0.3.13
libsoxr-0.1.1
libvpx-v1.3.0-4832-gc3a9056
wavpack-4.70.0
libwebp-0.4.2
x264 rev.2491 git-24e4fed (make fprofiled)
x265 1.4+67-8191e0d02455
xvidcore-1.3.3
libiconv-1.14
freetype-2.5.3
expat-2.1.0
fontconfig-2.11.1
fribidi-0.19.6
libass-0.12.0
SDL-1.2.15

最適化オプションは、以下のようにしています。

最適化無し版
--extra-cflags="-march=i686 -mtune=generic" --enable-memalign-hack

Pentium4最適化版
--extra-cflags="-mtune=pentium4 -mfpmath=sse -msse" --cpu=pentium4

Core2最適化版
--extra-cflags="-mtune=core2 -mfpmath=sse -msse" --cpu=i686

Athlon64最適化版
--extra-cflags="-mtune=athlon64 -mfpmath=sse -msse" --cpu=i686

Phenom最適化版
--extra-cflags="-mtune=amdfam10 -mfpmath=sse -msse" --cpu=i686

$ ./configure --enable-gpl --enable-version3 --enable-avisynth --enable-fontconfig --enable-libass --enable-libbluray --enable-libcaca --enable-libcdio --enable-libfreetype --enable-libfribidi --enable-libgme --enable-libgsm --enable-libilbc --enable-libmodplug --enable-libmp3lame --enable-libopencore-amrnb --enable-libopencore-amrwb --enable-libopenjpeg --enable-libopus --enable-librtmp --enable-libsoxr --enable-libspeex --enable-libtheora --enable-libtwolame --enable-libvidstab --enable-libvo-aacenc --enable-libvo-amrwbenc --enable-libvorbis --enable-libvpx --enable-libwavpack --enable-libwebp --enable-libx264 --enable-libx265 --enable-libxvid --enable-opengl --disable-outdev=sdl --enable-w32threads --disable-debug --extra-ldflags=-static --extra-cflags="-mtune=athlon64 -mfpmath=sse -msse" --optflags="-O2 -finline-functions"

※--extra-cflagsは、最適化の種類により異なります。