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FFmpeg最新版(2015/08/16現在)、rev.74449(b4b2717)のWindows用バイナリを置いておきます。

ffmpeg_bin-74449.zip
ffmpeg_bin_pentium4-74449.zip (Pentium4最適化版)
ffmpeg_bin_core2-74449.zip (Core2最適化版)
ffmpeg_bin_athlon64-74449.zip (Athlon64最適化版)
ffmpeg_bin_phenom-74449.zip (Phenom最適化版)

ffplay_bin-74449.zip
ffprobe_bin-74449.zip

以下のライブラリをアップデートしました。

OpenH264 v1.4.1-20150814-git-8a96d06
gnutls-3.3.4
rtmpdump-2.4-20150114-git-a107cef GnuTLS版
aoTuV Beta6.03 (2015)
libvpx-v1.4.0-1121-gbbb9ca4
x264 rev.2579 git-73ae2d1
x265 1.7+418-d56b2466c044
xvidcore-1.3.4
freetype-2.6
fontconfig-2.11.94
fribidi-0.19.7
libass-0.12.3

mbed TLSは、1.3.xから2.0.0になってAPIが大幅に変わり、rtmpdumpを修正しきれなくなったため、今回からGnuTLSに変更しました。
そのついでに、configureオプションに「--enable-gnutls」を追加しました。

2016/02/27 追記
GnuTLSに必要なライブラリが抜けていたため、追加しました。
gmp-6.0.0a
nettle-3.1.1

その他、今回、自前でビルドしたgcc-5.2.0とmingw-w64-v4.0.4で、全部コンパイルしなおしました。


バイナリはどれを使っても大丈夫だと思いますが、SSE2に対応していないCPU(Duron、Sempronの一部、Pentium3など)をお使いの方は、最適化無し版を使ってみてください。

最適化無し版でもエラーが出る場合は、サポート外とします。

zipファイルを解凍すると、ffmpeg.exeが出てきますので、携帯動画変換君のcoresフォルダに置くなり、単体で使うなりしてください。

携帯動画変換君のffmpeg.exeとは、オプションの互換性がありませんので、上書きする際はご注意ください。

FFmpegのコンパイルは、以下の記事を参考にしてください。
FFmpegのコンパイル (2014/02/17)

コンパイル環境：MinGW gcc-5.2.0
binutils-2.25
mingw-w64-v4.0.4

各ライブラリのバージョンは、以下の通りです。
nasm-2.11.08
yasm-1.3.0
zlib-1.2.8
bzip2-1.0.6
libbluray-0.8.1
libcaca-0.99.beta19
libcdio-0.93
libcdio-paranoia-10.2+0.93+1
game-music-emu-0.6.0
gsm-1.0.14
libilbc-2.0.3-dev-20150113-git-e762d0e
libmodplug-0.8.8.5
lame-3.99.5
OpenH264 v1.4.1-20150814-git-8a96d06
openjpeg-1.5.2
opus-1.1
opencore-amr-0.1.3
vid.stab-v1.1-20150529-git-97c6ae2
vo-aacenc-0.1.3
vo-amrwbenc-0.1.3
gmp-6.0.0a
nettle-3.1.1
gnutls-3.3.4
rtmpdump-2.4-20150114-git-a107cef GnuTLS版
libogg-1.3.2
aoTuV Beta6.03 (2015)
libtheora-1.1.1
speex-1.2rc1
twolame-0.3.13
libsoxr-0.1.1
libvpx-v1.4.0-1121-gbbb9ca4
wavpack-4.75.0
libwebp-0.4.3
x264 rev.2579 git-73ae2d1 (make fprofiled)
x265 1.7+418-d56b2466c044
xvidcore-1.3.4
libiconv-1.14
freetype-2.6
expat-2.1.0
fontconfig-2.11.94
fribidi-0.19.7
libass-0.12.3
SDL-1.2.15

最適化オプションは、以下のようにしています。

最適化無し版
--extra-cflags="-march=i686 -mtune=generic" --enable-memalign-hack

Pentium4最適化版
--extra-cflags="-mtune=pentium4 -mfpmath=sse -msse" --cpu=pentium4

Core2最適化版
--extra-cflags="-mtune=core2 -mfpmath=sse -msse" --cpu=i686

Athlon64最適化版
--extra-cflags="-mtune=athlon64 -mfpmath=sse -msse" --cpu=i686

Phenom最適化版
--extra-cflags="-mtune=amdfam10 -mfpmath=sse -msse" --cpu=i686

$ ./configure --enable-gpl --enable-version3 --enable-avisynth --enable-fontconfig --enable-gnutls --enable-libass --enable-libbluray --enable-libcaca --enable-libcdio --enable-libfreetype --enable-libfribidi --enable-libgme --enable-libgsm --enable-libilbc --enable-libmodplug --enable-libmp3lame --enable-libopencore-amrnb --enable-libopencore-amrwb --enable-libopenh264 --enable-libopenjpeg --enable-libopus --enable-librtmp --enable-libsoxr --enable-libspeex --enable-libtheora --enable-libtwolame --enable-libvidstab --enable-libvo-aacenc --enable-libvo-amrwbenc --enable-libvorbis --enable-libvpx --enable-libwavpack --enable-libwebp --enable-libx264 --enable-libx265 --enable-libxvid --enable-opengl --disable-outdev=sdl --enable-w32threads --disable-dxva2 --disable-debug --extra-ldflags=-static --extra-cflags="-mtune=athlon64 -mfpmath=sse -msse" --optflags="-O2 -finline-functions"

※--extra-cflagsは、最適化の種類により異なります。