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映像は1Mbps 1280x720サイズ、音声はNero AAC 192kbps 48kHz、動画フォーマットはmatroskaです。
ビットレートや画面サイズなどは、お好みで変更してください。
動画フォーマットは、今のところmatroskaのみ指定できるようです。

2014/03/21 追記
当サイトで配布しているffmpeg rev.61665から、動画フォーマットはmatroskaの他、mp4も指定できるようになっています。
サンプルの、出力動画ファイルのフォーマットと拡張子をmp4に変更しました。

2014/02/25 追記
TemporaryFileの削除コマンドを入れ忘れていたので、追加しました。

Title=【動画】x265 + Nero AAC 720p 30fps
Command0=""<%AppPath%>\cores\ffmpeg" -y -i "<%InputFile%>" -vn -acodec pcm_s16le -ac 2 -ar 48000 "<%TemporaryFile%>.wav""
Command1=""<%AppPath%>\cores\neroAacEnc" -if "<%TemporaryFile%>.wav" -lc -br 192000 -of "<%TemporaryFile%>.aac""
Command2=""<%AppPath%>\cores\ffmpeg" -y -i "<%TemporaryFile%>.aac" -i "<%InputFile%>" -acodec copy -vcodec libx265 -preset medium -tune ssim -x265-params "me=2" -s 1280x720 -aspect 16:9 -r 29.97 -sws_flags lanczos+print_info -b 1M -bt 1M -f mp4 -threads 3 "<%OutputFile%>.mp4""
Command3="rm "<%TemporaryFile%>.wav""
Command4="rm "<%TemporaryFile%>.aac""


FFmpeg内蔵のAACエンコーダを使う場合は、以下のようになります。

Title=【動画】x265 + 内蔵AAC(experimental) 720p 30fps
Command0=""<%AppPath%>\cores\ffmpeg" -y -i "<%InputFile%>" -vcodec libx265 -preset medium -tune ssim -x265-params "me=2" -s 1280x720 -aspect 16:9 -r 29.97 -sws_flags lanczos+print_info -b 1M -bt 1M -acodec aac -strict experimental -ab 192k -ac 2 -ar 48000 -f mp4 -threads 3 "<%OutputFile%>.mp4""


今のところ、libx265関連で指定できるオプションは、
-preset
-tune
-x265-params
です。

-x265-params を使えば、libx265のオプションをすべて使用できます。
-x265-params "me=2:rc-lookahead=20"
などのように、libx265のオプションを指定できます。

2014/03/21 追記
SSEなど、どれが有効になるかはCPUを自動判別しているのですが、asmというオプションが追加され、手動で指定できるようになっています。
-x265-params "asm=SSE2,SlowCTZ"
など、有効にしたいものをコンマで区切ります。
CPUが対応していないものを指定すると、エラーになります。

何が指定できるかは、ソースコード「cpu.cpp」を参照してください。
https://bitbucket.org/multicoreware/x265/src/fe3fcd9838c02fb65fed8638a13dea9f06f8a9be/source/common/cpu.cpp?at=default


オプションについての説明は、x265のダウンロードページ
https://bitbucket.org/multicoreware/x265/downloads
ここから、
x265 Evaluators Guide Feb 12 2014.pdf
x265 Evaluators Guide March 16 2014.pdf
をダウンロードして、参照してください。

いろいろお試しください。

動画と音声の設定値は、お好みで変更してください。

1回目でvid.stabの解析のみ行って、2回目で解析結果を使ってエンコードする場合。

Title=【動画】vid.stab x264 + Nero AAC 720p 30fps ステレオ mp4
Command0=""<%AppPath%>\cores\ffmpeg" -y -i "<%InputFile%>" -vn -acodec pcm_s16le -ac 2 -ar 48000 "<%TemporaryFile%>.wav""
Command1=""<%AppPath%>\cores\neroAacEnc" -if "<%TemporaryFile%>.wav" -lc -br 192000 -of "<%TemporaryFile%>.aac"
Command2=""<%AppPath%>\cores\ffmpeg" -y -i "<%InputFile%>" -vf vidstabdetect -f null -"
Command3=""<%AppPath%>\cores\ffmpeg" -y -i "<%TemporaryFile%>.aac" -i "<%InputFile%>" -vf vidstabtransform -acodec copy -vcodec libx264 -b 3M -bt 3M -s 1280x720 -aspect 16:9 -r 29.97 -sws_flags lanczos+print_info -preset medium -tune film -weightp 2 -f mp4 -threads 3 "<%OutputFile%>.mp4""
Command5="rm "<%TemporaryFile%>.wav""
Command6="rm "<%TemporaryFile%>.aac""


1回目でvid.stabの解析とエンコードのpass 1を行って、2回目で解析結果を使って2passエンコードする場合。

Title=【動画】2pass vid.stab x264 + Nero AAC 720p 30fps ステレオ mp4
Command0=""<%AppPath%>\cores\ffmpeg" -y -i "<%InputFile%>" -vn -acodec pcm_s16le -ac 2 -ar 48000 "<%TemporaryFile%>.wav""
Command1=""<%AppPath%>\cores\neroAacEnc" -if "<%TemporaryFile%>.wav" -lc -br 192000 -of "<%TemporaryFile%>.aac"
Command2=""<%AppPath%>\cores\ffmpeg" -y -i "<%InputFile%>" -pass 1 -vf vidstabdetect -an -vcodec libx264 -b 3M -bt 3M -s 1280x720 -aspect 16:9 -r 29.97 -sws_flags lanczos+print_info -preset medium -tune film -weightp 2 -f mp4 -threads 3 "<%TemporaryFile%>.mp4""
Command3=""<%AppPath%>\cores\ffmpeg" -y -i "<%InputFile%>" -pass 2 -vf vidstabtransform -an -vcodec libx264 -b 3M -bt 3M -s 1280x720 -aspect 16:9 -r 29.97 -sws_flags lanczos+print_info -preset medium -tune film -weightp 2 -f mp4 -threads 3 "<%TemporaryFile%>.mp4""
Command4=""<%AppPath%>\cores\ffmpeg" -y -i "<%TemporaryFile%>.aac" -i "<%TemporaryFile%>.mp4" -acodec copy -vcodec copy -f mp4 "<%OutputFile%>.mp4""
Command5="rm "<%TemporaryFile%>.wav""
Command6="rm "<%TemporaryFile%>.aac""
Command7="rm "<%TemporaryFile%>.mp4""


各パラメータは、以下のページのAll Parametersを参照してください。
http://public.hronopik.de/vid.stab/features.php

各パラメータの、FFmpegのデフォルト値は以下の通りです。
上記のページと違うものがいくつかあります。

Stabilize plugin (-vf vidstabdetect)
result=transforms.trf
shakiness=5
accuracy=9
stepsize=6
mincontrast=0.25
tripod=0
show=0
algoはFFmpegから変更できません。

Transform plugin (-vf vidstabtransform)
input=transforms.trf
smoothing=10
maxshift=-1
maxangle=-1.0
crop=0
invert=0
relative=1
zoom=0
optzoom=1
interpol=2
tripod=0
sharpenはFFmpegから変更できません。

cropは、
crop=0 または crop=keep
crop=1 または crop=black
という設定ができます。

interpolは、
interpol=0 または interpol=no
interpol=1 または interpol=linear
interpol=2 または interpol=bilinear
interpol=3 または interpol=bicubic
という設定ができます。


パラメータを複数設定する時は、以下のようにコロンでつなぎます。
-vf vidstabdetect=result=transforms.trf:shakiness=5:accuracy=9:stepsize=6:mincontrast=0.25:tripod=0:show=0
-vf vidstabtransform=input=transforms.trf:smoothing=10:maxshift=-1:maxangle=-1.0:crop=0:invert=0:relative=1:zoom=0:optzoom=1:interpol=2:tripod=0

いろいろお試しくださいませ。

字幕ファイル、字幕を入れたい動画が用意できたら、次に「携帯動画変換君」の設定です。

「ffmpeg.exe」は、当サイトのFFmpeg rev.35550など、字幕ファイルの読み込みに対応しているものを使用してください。

コマンドプロンプトなどで、
ffmpeg -filters
と実行して、
ass Render subtitles onto input video using the libass library.
という行があれば、字幕ファイルの読み込みに対応しています。


次に、Windowsのフォント情報を取得するための「fonts.conf」ファイルを用意します。

GTK+ Download: Windows (32-bit)
http://www.gtk.org/download/win32.php
ここにある、
Required third party dependencies
Fontconfig 2.8.0 Run-time から、
fontconfig_2.8.0-2_win32.zip
をダウンロードします。

zipファイルを解凍すると、
etc\fonts\fonts.conf
というファイルがありますので、「携帯動画変換君」のcoresフォルダにfontsフォルダを作成して、コピーします。

コマンドラインで使用する場合は、「ffmpeg.exe」があるフォルダを基準にして、「fonts\fonts.conf」があれば良いです。

字幕ファイルはどこに置いても良いのですが、「3GP_Converter.exe」と同じフォルダに置けば、パスを指定しなくても良いです。

字幕ファイルを「sub.ass」とすると、

C:\Program Files\3GP_Converter\sub.ass
C:\Program Files\3GP_Converter\cores\ffmpeg.exe
C:\Program Files\3GP_Converter\cores\fonts\fonts.conf

と、なっていればOKです。


「携帯動画変換君」の「Transcoding.ini」の設定例は、以下の通りです。
解像度やビットレートなどは、目的に合わせて変更してください。

設定例はx264のmp4ですが、字幕を映像に埋め込むので、動画コーデックは、x264の他、Xvidなど、コンテナフォーマットは、mp4、3gp、aviなど何でも良いです。

字幕ファイルは、「-vf ass="sub.ass"」の所を変更してください。
字幕ファイルの文字コードは、「UTF-8」で保存してください。
「SJIS」だと文字化けしました。

Title=【動画】字幕付き x264 + Nero AAC 360p 30fps mp4
Command0=""<%AppPath%>\cores\ffmpeg" -y -i "<%InputFile%>" -vn -acodec pcm_s16le -ac 2 -ar 44100 "<%TemporaryFile%>.wav""
Command1=""<%AppPath%>\cores\neroAacEnc" -if "<%TemporaryFile%>.wav" -lc -br 128000 -of "<%TemporaryFile%>.aac"
Command2=""<%AppPath%>\cores\ffmpeg" -y -i "<%TemporaryFile%>.aac" -i "<%InputFile%>" -acodec copy -vcodec libx264 -b 768k -s 640x360 -aspect 16:9 -r 29.97 -sws_flags lanczos+print_info -me_method umh -g 150 -qcomp 0.7 -qblur 0.5 -qmin 10 -qmax 51 -qdiff 4 -subq 6 -me_range 16 -coder vlc -sc_threshold 50 -flags +loop -flags2 +mixed_refs -keyint_min 30 -cmp chroma -level 30 -refs 3 -i_qfactor 0.714286 -f mp4 -vf ass="sub.ass" -threads 3 "<%OutputFile%>.mp4""
Command3="rm "<%TemporaryFile%>.wav""
Command4="rm "<%TemporaryFile%>.aac""

あとは、「携帯動画変換君」に動画をドロップすれば、エンコードが始まります。
最初の1回だけ、Windowsのフォント情報を取得するのに時間がかかります。


洋画に字幕を付けたり、ミュージックビデオに歌詞を付けたり、いろいろ使い道はありそうですね。

以上、みなさまのご参考になれば幸いです。